2. 공통매입세액의 안분계산
사업자가 과세사업과 면세사업을 겸영하고 있는 경우 면세사업에 관련된 매입세액의 계산은 실지귀속에 따라 계산하지만, 과세사업과 면세사업에 공통으로 사용되어 실지귀속을 구분할 수 없는 공통매입세액에 대해서는 안분계산방법에 의하여 면세사업에 관련된 매입세액을 계산한다(부령 §81 ①).
(1) 원칙적 안분계산방법
면세사업 관련 매입세액
원칙：당해 과세기간의 공급가액 비율로 안분계산
공통매입세액의 안분계산은 원칙적으로 해당 과세기간의 공급가액을 기준으로 한다.
다만, 예정신고를 하는 때에는 예정신고기간의 공급가액 비율로 안분계산하고, 확정신고를 하는 때에 정산한다(부령 §81 ① 단서).
다만, 예정신고를 하는 때에는 예정신고기간의 공급가액 비율로 안분계산하고, 확정신고를 하는 때에 정산한다(부령 §81 ① 단서).
예외：직전 과세기간의 공급가액 비율로 안분계산
과세사업과 면세사업에 공통으로 사용되는 재화를 공급받은(즉 매입한) 과세기간 중에 그 재화를 다시 공급(즉 매각)함에 따라 매출세액 과세표준을 직전 과세기간의 공급가액 비율로 안분계산한 경우 그 재화의 매입세액에 대해서는 직전 과세기간의 공급가액 비율로 안분계산한다(부령 §54 ②).
주:
이는 동일과세기간 중에 매입과 매각이 동시에 이루어진 공통사용자산에 대하여 안분계산 기준을 달리 적용하는 경우 발생할 수 있는 납부세액의 왜곡현상을 막기 위한 조치이다.
이는 동일과세기간 중에 매입과 매각이 동시에 이루어진 공통사용자산에 대하여 안분계산 기준을 달리 적용하는 경우 발생할 수 있는 납부세액의 왜곡현상을 막기 위한 조치이다.
안분계산의 배제
다음의 경우에는 매입세액을 안분계산하지 않고 전액을 공제한다(부령 §81 ②).
- ① 해당 과세기간의 총공급가액 중 면세공급가액이 5% 미만인 경우의 공통매입세액(단, 공통매입세액이 5백만원 이상인 경우는 제외)
- ② 해당 과세기간 중의 공통매입세액 합계액이 5만원 미만인 경우의 매입세액
- ③해당 과세기간에 신규로 사업을 개시한 사업자가 당해 과세기간에 공급(매각)한 공통사용재화에 대한 매입세액